通常情况下，进行超声内镜检查有无痛感，与检查方式、患者自身痛感密切相关。临床上，多采用无痛超声内镜，可以较好地显示消化道病变，较少产生疼痛感。

1、检查方式：超声内镜是诊断消化道病变较先进的技术手段，较常见的是经口超声内镜，通常需要经口进入，从而对整个消化道进行清晰地观察，能够较为清晰地显示病变。而普通内镜，如胃镜、肠镜等，是从肛门进入，通常没有经过阴道，所以检查过程中一般不会产生疼痛感;

2、患者自身痛感密切相关：如果患者对疼痛较为敏感，进行超声内镜检查时，会出现恶心、反胃等不适症状。此外，如果患者存在一些基础疾病，如糖尿病、高血压等，在检查过程中可能会出现控制不住的血液流出等情况，从而导致检查过程中出现疼痛感。

超声内镜技术已经发展得较为成熟，较之前所采用的是生理盐水作为胃镜、肠镜的介入剂，通常会在检查前通过口服造影剂使胃肠道清晰地观察病变。由于造影剂不具有明显的刺激性，所以大多数患者不会出现不适感。此外，超声内镜的图像较为清晰，可以看清管壁上较小的结节、息肉等黏膜隆起性病变，如果存在上述情况，通常可以进行初步诊断。