孕五十天超声检查痛，可能是由于检查时不配合医生进行，导致的检查结果不准确，也可能是由于先兆流产、异位妊娠、盆腔炎等原因导致的，建议遵医嘱进行针对性处理。

1、检查不配合医生进行：如果检查时孕妇处于饥饿状态，导致胎儿不爱活动，或者医生操作不当等，可能会导致检查时不顺利，进而导致孕妇在孕五十天超声检查痛，此时建议孕妇适当进食，以安抚胎儿，可以通过走动、听音乐等方式分散注意力，从而缓解疼痛;

2、先兆流产：可能是由于胚胎染色体异常、子宫畸形等原因导致，会出现少量阴道出血、阵发性腹痛等症状。如果孕妇处于不良环境、过度劳累等不良刺激状态下，会加重疼痛症状，出现孕五十天超声检查痛的情况。建议遵医嘱使用黄体酮胶囊等药物保胎治疗，若无法继续妊娠，需要及时终止妊娠;

3、异位妊娠：可能由于输卵管炎症、输卵管发育不良、输卵管妊娠史等原因导致的受精卵在子宫腔外着床，多发生在输卵管部位，由于胚胎不断发育增大，对周围组织造成挤压，从而出现孕五十天超声检查痛的现象。对于有生育需求的女性可进行输卵管开窗术治疗，若无生育需求的女性可进行输卵管切除术;

4、盆腔炎：可能由于不良卫生习惯、免疫功能降低等原因导致，会出现阴道分泌物增多、阴道异常出血等症状。如果孕妇自身患有盆腔炎症，由于炎症刺激盆腔部位引起水肿、充血等情况，超声检查时会出现孕五十天超声检查痛的表现。建议遵医嘱使用头孢克肟片等药物治疗，以免对胎儿造成影响。