肛门腔内超声检查一般不会产生疼痛，因为超声探头比较细小，大多数人群都可以忍受。如果比较敏感，可能会有疼痛感。肛门腔内超声检查是针对肛门疾病的检查方式，常见的疾病有肛周脓肿、痔疮、直肠脱垂等。

1、肛周脓肿：是位于肛门周围皮下间隙内的脓肿，大多继发于肛腺感染。患者进行肛门腔内超声检查时，探头会将探头放于肛门内，进行超声检查。由于探头比较细小，一般不会对皮肤以及周围组织造成损伤，所以检查时不会产生疼痛。但是如果对痛觉比较敏感，患者可能会感到疼痛;

2、痔疮：是比较常见的肛门直肠疾病，痔疮患者进行肛门腔内超声检查时，可以清晰地显示出痔核的大小、数目、位置等。由于痔核在肛门腔内，所以进行肛门腔内超声检查时一般不会产生疼痛，如果痔核体积较大，在排便过程中，痔核可能会脱出肛门外，刺激周围皮肤后引起疼痛;

3、直肠脱垂：指的是直肠壁部分或全层向下移位，发病原因与年老体弱、营养不良、腹内压频繁增高有关。如果进行肛门腔内超声检查时，探头放置于肛门内，可能会对直肠黏膜造成刺激，进而引起疼痛。

除此之外，如果是进行直肠息肉、直肠黏膜环切吻合术等，也需要进行肛门腔内超声检查。在检查过程中，需要暴露肛门，而且要将探头伸入肛门内，进行组织学检查。如果在进行这项检查时感到疼痛，建议及时告知医生，在医生指导下做好准备工作后再进行检查。