超声内镜是将内镜探头插入消化道内，直接观察消化道内病变的一种检查手段。通常可以检查食管、胃、十二指肠、小肠、大肠等器官，明确被检者是否患有疾病，或者观察器官是否存在病变。

1、食管：可以检查出食管炎、食管息肉、食管肿瘤等疾病，可帮助明确疾病类型，明确病变程度;

2、胃：可以检查出慢性胃炎、胃溃疡、胃息肉等疾病，明确疾病类型与病变程度，判断治疗方法;

3、十二指肠：可以检查出十二指肠乳头炎、十二指肠溃疡等疾病，明确疾病类型与病变程度，判断治疗方法;

4、小肠：可以检查出小肠炎、小肠息肉等疾病，明确疾病类型与病变程度，判断治疗方法;

5、大肠：可以检查出大肠炎、大肠息肉等疾病，以及十二指肠球部溃疡、局限性肠炎等治疗方法，还可以辅助检查出一些肿瘤，对此可进行早期诊断。

此外，超声内镜也可用于检查肛门部位，明确是否有痔疮、肛裂等疾病，以及是否存在肛周脓肿、肛瘘等现象。

一般情况下超声内镜操作简单、便捷，对患者损伤较小，且检查时无明显不适感，较为常用。但如果存在幽门狭窄或者胃肠道气体过多的情况下，一般不建议使用超声内镜检查。另外，超声内镜也有一些局限性，比如对于胃食管反流病的诊断，由于超声内镜的局限性，可能会看不到胃黏膜的病变，容易漏诊或误诊。