超声检查有两个孕囊，可能提示为双胎妊娠，但也可能是由于检查误差导致。此外，还可能与葡萄胎、异位妊娠有关，需针对不同情况进行分析，并及时采取措施进行处理。

1、双胎妊娠：双胎妊娠是一种比较特殊的妊娠状态，多由于胎盘绒毛间隙发育不良、胎盘面积过大等因素导致。进行超声检查时可在宫腔内发现两个孕囊，还可出现不同程度的胎芽、胎心。对于此类情况，一般需要加强孕期监测，以防止发生流产、早产、胎儿生长受限等情况。若发生流产、早产等情况，需及时进行保胎治疗，可遵医嘱应用黄体酮、地屈孕酮等药物;

2、葡萄胎：是一种良性妊娠滋养细胞疾病，由于滋养细胞增生，可导致超声检查时发现两个孕囊，还可伴有腹痛、阴道流血等症状。此类情况较为少见，一旦确诊，需及时进行清宫手术治疗;

3、异位妊娠：即受精卵在子宫体腔以外的部位着床，也可导致超声检查时发现两个孕囊的情况，可伴有停经、腹痛、阴道流血等症状。针对异位妊娠，一般需及时终止妊娠，以免导致不良后果;

4、其他原因：如绒毛膜癌等，当滋养细胞异常增殖时，也可出现超声检查有两个孕囊的情况，还可伴有阴道流血、子宫复旧不全等症状。此类情况较为少见，一旦确诊，需及时进行手术治疗，还需联合放化疗。

超声检查有两个孕囊，需及时完善其他检查，如无创DNA检查、羊水穿刺等，以明确是否存在染色体异常的情况。若明确存在染色体异常，需及时进行下一步的治疗措施，以免影响胎儿的健康成长。