超声内镜是指在内镜下可以将体内的病变情况成像，主要用于食管、胃、肠等消化道疾病的诊断。做超声内镜检查有一定局限性，因为超声内镜比较局限，对于黏膜下的病变、隆起性病变等，通常不能明确诊断，而针对于息肉等良性病变，大多数情况下也不能明确诊断。

1、黏膜下的病变：由于超声内镜比较局限，对于黏膜下的病变，如隆起性病变，超声内镜检查通常不能明确诊断，可结合其他检查，如胃镜、食管镜等，进行综合判断;

2、黏膜下的隆起性病变：超声内镜可以对胃黏膜下的病变进行超声判断，如果存在黏膜下的隆起性病变，如胃息肉、胃平滑肌瘤等，可以明确存在良、恶性的情况;

3、胆道系统病变：如胆囊结石、胆囊肿瘤等，超声内镜也可以清晰显示，并根据结石、肿瘤的大小、形态、位置，以及胆管的阻塞情况，对胆道系统病变作出良、恶性的判断;

4、良性肿瘤：如胰腺假性囊肿、多发性肝囊肿等，也可以通过超声内镜进行检查，并根据组织学表现，以及既往病史进行综合判断;

5、恶性肿瘤：如食管癌、胃癌、肝癌等，超声内镜检查对恶性肿瘤的判断有明显的局限性，通常不能明确诊断，可结合CT、病理学检查等进行综合判断。

除上述情况外，超声内镜也可对血管进行检查，主要用于食管、胃、肠等消化道血管的检查，部分腹部的大血管也可以通过超声内镜进行检查。多数情况下超声内镜比较局限，对于某些疾病可能会有较好的诊断作用，但由于个体差异，如病变大小、形状等有所不同，因此需要在医生指导下完善其他检查，进行综合判断。