通常情况下，进行超声波内镜检查不痛苦，检查时医生会将一个清晰的超声探头放于患者体内，对体内病变情况进行观察，一般不会造成患者痛苦。但如果患者存在胆囊方面的疾病，可能会引起不适感，主要表现为阵发性的右上腹疼痛，还可能会伴有恶心、呕吐等症状。

1、阵发性的右上腹疼痛：做超声波内镜检查可能会引起阵发性的右上腹疼痛，因为超声探头伸入到胆囊内时，会对胆囊组织进行全面观察，由于个体差异，部分患者会出现阵发性右上腹疼痛，但一般不会持续较长时间。如果患者进行超声波内镜检查前适当口服止痛药物，如阿司匹林、布洛芬等，可以缓解症状;

2、恶心、呕吐：如果患者胆囊疾病比较严重，如存在胆囊炎、胆结石等，或胃肠道本身存在疾病，如存在急性胃肠炎、胃溃疡等，在进行超声波内镜检查时，可能会出现一定的不适感，主要表现为恶心、呕吐等症状，但一般持续时间不会太长，大部分患者可以忍受，必要时可以选择无痛超声内镜检查;

3、其他症状：部分患者在超声波内镜检查时，还可能会出现焦虑、恐惧的心理问题。因为在做超声波内镜检查时会感到不适，所以会影响睡眠质量，从而导致焦虑、恐惧等症状。

超声波内镜技术已经发展得比较成熟，是比较先进的消化内镜技术。如果患者胆囊部位存在不适，可以在超声波内镜下进行检查，并进行相应治疗。