超声波内镜检查一般不痛苦，因为超声波内镜是无创检查，是将内镜探头插入消化道进而获取消化道图像，通常没有痛苦。超声内镜是比较先进的消化内镜技术，与胃镜相比，超声内镜检查的优点主要为无创、无辐射、诊断准确率高、并发症少等。

1、无创：超声内镜是无创检查，所以不痛苦，但由于内镜是通过口腔进入消化道，检查过程中可能会产生恶心、干呕等症状;

2、无辐射：超声内镜是比较先进的消化内镜技术，主要是利用微型高频电磁场使内镜当中的离子发生共振，使得体内的水分子等反射回来，形成图像用于临床诊断，通常不会对身体造成辐射;

3、诊断准确率高：通过超声内镜检查，可以较为清晰地显示出食管、胃、小肠、大肠等部位的病变，对于肿瘤疾病的诊断准确率较高，甚至可以达到病理活检的作用;

4、并发症少：由于超声内镜是无创性检查，所以一般不会引起患者出现不适症状，较为安全。

此外，超声内镜检查前需进行饮食控制，检查前3天应当禁食、禁水，由于胃肠道内聚积了大量的食物残渣和水液，如果胃肠道清理不干净，可能会影响诊断结果。进行超声内镜检查时，应当放松心情，避免过于紧张，尽量在医生指导下进行检查。